Science

Occurrence of quinolone-resistant Escherichia coli in environmental samples from a sow pool system in Switzerland

S. Von Ah1, R. Stephan2, K. Zurfluh2, X. Sidler1, D. Kümmerlen1
1Department for Farm Animals, Division of Swine Medicine, Vetsuisse Faculty, University of Zurich, 2Institute for Food Safety and Hygiene, Vetsuisse Faculty, University of Zurich

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Abstracts: English - Deutsch - Français - Italiano

English

Occurrence of quinolone-resistant Escherichia coli in environmental samples from a sow pool system in Switzerland

Fluoroquinolones (FQ) undergo minimal metabolization in animals and are excreted via faeces and urine, where they enter the environment almost unchanged. In this study we investigated the presence of quinolone-resistant Escherichia coli (E. coli) in the environment of 65 farms of a sow pool system in Switzerland. Two hundred and seventy-nine samples from liquid manure and wipes of dust and pen walls were collected and the use of FQ on the farms was investigated. From 45% of dust samples, 52% of pen wall samples and 69% of liquid manure samples quinolone-resistant E. coli (QRE) were cultivated. Significant higher counts of quinolone-resistant colonies were found in liquid manure samples than in dust (p < 0.01) or pen wall samples (p < 0.05). Samples from breeding farms were significantly more often positive than samples from fattening farms (p < 0.01). Samples taken from farms using FQ were significantly more frequently positive for QRE than samples from farms without FQ usage (p < 0.01). On 97% of the farms with FQ use and 85% (23/27) of the farms without FQ use QRE could be found in at least one sample (no significant difference). Overall, QRE were widespread in the environment of the investigated pig farms.

Keywords: Quinolone resistance, fluoroquinolones, liquid manure samples, resistance profile, pigs, dust samples

Deutsch

Vorkommen von Chinolon -resistenten Escherichia coli in Umweltproben aus einem arbeitsteiligen Ferkel­produktionsring

Fluorchinolone (FQ) werden bei Tieren nur minimal metabolisiert und nahezu unverändert über Kot und Urin ausgeschieden. In der vorliegenden Studie wurden Umweltproben aus 65 Betrieben eines arbeitsteiligen Ferkelproduktionsrings in der Schweiz auf das Vorkommen von FQ-resistenten Escherichia coli (E. coli) untersucht. In den Betrieben wurden 279 Proben von Gülle und Staub, sowie Wischproben von den Buchtenwänden gesammelt und der Einsatz von FQ wurde untersucht. Chinolon-resistente E. coli (QRE) wurden aus 45% der Staubfilterproben, 52% der Stallwandproben und 69% der Gülleproben kultiviert. Die Gülleproben enthielten signifikant höhere QRE-Koloniezahlen als Staub- (p < 0.01) und Wischproben (p < 0.05). Proben aus Zuchtbetrieben waren signifikant häufiger positiv, als Proben aus Mastbetrieben (p < 0.01). Proben aus Betriebe mit FQ-Einsatz waren signifikant häufiger positiv für QRE als Betriebe ohne FQ-Einsatz. In 97% der Betriebe mit FQ-Einsatz und 85% (23/27) der Betriebe ohne FQ-Einsatz konnte QRE in mindestens einer Probe nachgewiesen werden (kein signifikanter Unterschied). Insgesamt waren QRE in der Umgebung der untersuchten Schweinezuchtbetriebe weit verbreitet.

Schlüsselwörter: Chinolonresistenz, Fluorchinolone, Gülleproben, Resistenzprofil, Schweine, Staubproben

Français

Présence d’Escherichia coli résistants à la quinolone dans des échantillons environnementaux prélevés dans un pool de truies en Suisse

Les fluoroquinolones (FQ) subissent une métabolisation minimale chez les animaux et sont excrétées par les fèces et l’urine par l’intermédiaire desquelles elles arrivent pratiquement inchangées dans l’environnement. Dans cette étude, nous avons étudié la présence d’Escherichia coli (E. coli) résistants à la quinolone dans l’environnement de 65 exploitations d’un système de pool de truies en Suisse. Deux cent septante neuf échantillons de lisier, de lingettes recueillant des poussières et de parois de boxesont été collectés et l’utilisation de FQ dans les fermes a été étudiée. Sur 45% des échantillons de poussières, 52% des échantillons de parois de boxes et 69% des échantillons de lisier, des E. coli résistants à la quinolone (QRE) ont été cultivés. Des quantités significativement plus élevées de colonies résistantes à la quinolone ont été trouvées dans des échantillons de lisier par rapport aux échantillons de poussière (p <0,01) ou de parois de boxes (p <0,05). Les échantillons provenant d’élevages étaient significativement plus souvent positifs que ceux provenant d’exploitations d’engraissement (p <0,01). Les échantillons prélevés dans les exploitations utilisant de la FQ étaient significativement plus souvent positifs pour le QRE que les échantillons provenant d’exploitations sans utilisation de FQ (p <0,01). Sur 97% des exploitations utilisant de la FQ et 85% (23/27) des exploitations sans utilisation de FQ, des QRE était présente dans au moins un échantillon (pas de différence significative). Dans l’ensemble, les QRE étaient répandus dans l’environnement des élevages porcins étudiés.

Mots-clés: Résistance à la quinolone, fluoroquinolones, échantillons de lisier, profil de résistance, porcs, échantillons de poussière

Italiano

Presenza di Escherichia coli resistente ai chinoloni in campioni ambientali di un sistema di aziende di scrofe in Svizzera

I fluorochinoloni (FQ) subiscono una metabolizzazione minima negli animali e vengono escreti attraverso le feci e le urine, dove entrano nell’ambiente quasi immutati. In questo studio abbiamo studiato la presenza di Escherichia coli (E. coli) resistente ai chinoloni nell’ambiente di un sistema di 65 aziende agricole per scrofe in Svizzera. Sono stati raccolti duecentosettantanove campioni di liquame, polvere e pareti del recinto ed è stato studiato l’uso di FQ nelle aziende agricole. Si è studiata una coltura di E. coli resistente ai chinoloni (ERC) costituita dal 45% dei campioni di polvere, 52% dei campioni di pareti del recinto e dal 69% dei campioni di liquame. Nei campioni di liquame sono state riscontrate colonie resistenti ai chinoloni in quantità significativamente più elevate che nei campioni di polvere (p < 0,01) o provenienti dalle pareti del recinto (p < 0,05). I campioni provenienti dalle aziende di allevamento sono risultati significativamente e più spesso positivi rispetto ai campioni provenienti dalle aziende di ingrasso (p < 0.01). I campioni prelevati da allevamenti che utilizzano FQ sono significativamente e piu frequentemente positivi all’ERC rispetto ai campioni provenienti da allevamenti che non utilizzano FQ (p < 0.01). Nel 97% delle aziende che usano FQ e nell’85% (23/27) delle aziende che non lo utilizzano, l’ERC è stata riscontrata in almeno un campione (nessuna differenza significativa). In generale si può affermare che l’ERC era diffusa nell’ambiente delle aziende di suini esaminate.

Parole chiavi: Resistenza ai chinoloni, fluorochinoloni, campioni di liquame, profilo di resistenza, suini, campioni di polvere.