Science

English

This study was conducted to investigate the occurrence and genetic characteristics of extended spectrum β-lactamase (ESBL) and methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in 80 samples of Swiss (n=36) and imported (n=44) raw chicken meat collected at retail level. In addition, ESBL-producers were screened for the presence of the plasmid-mediated colistin resistance gene mcr-1. Countries of import included Argentina (n=2), Austria (n=1), Brazil (n=3), Denmark (n=5), France (n=1), Germany (n=13), Hungary (n=5), Italy (n=8), and Slovenia (n=6). Forty ESBL-producing E. coli strains were isolated from 33 (41.3%) of the 80 samples, comprising seven (19.4%) of the Swiss and 26 (59%) of the imported samples. The most common blaESBL among the isolates were blaCTX-M-1 (n=14) and blaSHV-12 (n=16). Other genes comprised blaTEM-52 (n=4), blaCTX-M-2 (n=3), blaCTX-M-8 (n=1), blaCTX-M-14 (n=1) and a novel blaCTX-M-14-like variant (n=1). Two ESBL-producers isolated from samples from Germany (n=1) and Italy (n=1) tested additionally positive for the plasmid-mediated colistin resistance gene mcr-1. Six (7.5%) samples, all imported from Germany, were found to contain MRSA. Three isolates belonged to the livestock-associated CC398-MRSA-V-t034, and 3 to CC9-MRSA-IV-t13177, described here for the first time in chicken meat.

Keywords: antibiotic resistance, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, food, chicken meat

Deutsch

Für die vorliegende Studie wurden insgesamt 80 rohe Geflügelfleischproben auf das Vorkommen von extended-spectrum β-Laktamase (ESBL)- produzierenden Enterobacteriaceae und Methicillin-resistenten Staphylococcus aureus (MRSA) untersucht. Zusätzlich wurden die ESBL-Bildner auf das Vorhandensein des plasmid-kodierten Gens mcr-1 untersucht. Das Fleisch stammte aus der Schweiz (n=36), sowie aus Argentinien (n=2), Österreich (n=1), Brasilien (n=3), Dänemark (n=5), Frankreich (n=1), Deutschland (n=13), Ungarn (n=5), Italien (n=8), und Slovenien (n=6). Insgesamt wiesen 33 Proben (41.3%) ESBL-produzierende Enterobacteriaceae auf, wobei sieben (19.4%) aus Schweizer Fleisch und 26 (59%) aus importiertem Fleisch isoliert wurden. Am häufigsten wurden blaCTX-M-1 (n=14) und blaSHV-12 (n=16) gefunden, gefolgt von blaTEM-52 (n=4) blaCTX-M-2 (n=3), blaCTX-M-8 (n=1), blaCTX-M-14 (n=1) und eine neue blaCTX-M-14 Genvariante (n=1). Bei 2 ESBL-Bildnern von Proben aus Deutschland (n=1) und Italien (n=1) wurde zusätzlich das mcr-1, ein plasmid-kodiertes Resistenzgen gegen Colistin, nachgewiesen. Sechs Proben (7.5%), welche alle aus Deutschland stammten, waren MRSA positiv. Genotypisierung ordnete 3 der Stämme dem Nutztier-assoziiereten Klon CC398-MRSA-V-t034, und 3 weitere dem CC9-MRSA-IV-t13177 zu. Letzterer wird in dieser Arbeit erstmals in Geflügelfleischproben beschrieben.

Schlüsselwörter: Antibiotikaresistenz, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Lebensmittel, Geflügelfleisch

Français

Dans le cadre de la présente étude, on a examiné au total 80 échantillons de viande de volaille crue quant à la présence d’entérobactéries productrices de bétalactamase avec spectre élargi (ESBL) ainsi que de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline (MRSA). En outre les germes producteurs d’ESBL ont été examinés quant à la présence du gène mcr-1. La viande provenait de Suisse (n=36) ainsi que d’Argentine (n=2), d’Autriche (n=1), du Brésil (n=3), du Danemark (n=5), de France (n=1), d’Allemagne (n=13), de Hongrie (n=5), d’Italie (n=8) et de Slovénie (n=6). Au total, 33 échantillons (41.3%) contenaient des entérobactéries producteurs d’ESBL, 7 d’entre eux (19.4%) provenant de viandes suisses et 26 (59%) de viandes importées. Les variantes de gènes les plus fréquentes étaient blaCTX-M-1 (n=14) et blaSHV-12 (n=16) suivis par blaTEM-52 (n=4) blaCTX-M-2 (n=3), blaCTX-M-8 (n=1), blaCTX-M-14 (n=1) ainsi que par une nouvelle variante blaCTX-M-14 (n=1). Sur deux germes producteurs d’ESBL isolés sur des échantillons provenant d’Allemagne (n=1) et d’Italie (n=1), on a trouvé en outre le gène mcr-1 qui code la résistance vis-à-vis de la colistine. Six échantillons (7.5%), provenant tous d’Allemagne, étaient positifs aux MRSA. La génotypisation a permis d’en classer trois dans le clone associé aux animaux de rente CC398-MRSA-V-t034 et les trois autre dans le clone CC9-MRSA-IV-t13177. Ce dernier est décrit pour la première fois dans ce travail comme associé à des échantillons de viande de volaille.

Italiano

Nel presente studio, un totale di 80 campioni di carne di pollame cruda sono stati esaminati per determinare la presenza di b-lattamasi a spettro esteso (ESBL), di produzione di enterobatteri e di Staphylococcus aureus resistente alla meticillina (MRSA). Inoltre, i produttori di ESBL sono stati esaminati sulla presenza del plasmide codificato del gene mcr-1. La carne proveniva dalla Svizzera (n=36), dall’Argentina (n=2), dall’Austria (n=1), dal Brasile (n=3), dalla Danimarca (n=5), dalla Francia (n=1), dalla Germania (n=13), dall’Ungheria (n=5), dall’Italia (n=8) e dalla Slovenia (n=6). Un totale di 33 campioni (41.3%) presentavano produttori di enterobatteri ESBL, di cui sette isolati (19.4%) da carne svizzera e 26 (59%) da carni importate. Più di frequente sono stati rilevate blaCTX-M-1 (n=14) e blaSHV-12 (n=16), seguite da blaTEM-52 (n=4) blaCTX-M-2 (n=3), blaCTX-M-8 (n=1), blaCTX-M-14 (n=1) e una nuova variante genetica di blaCTX-M-14 (n=1). In 2 campioni di produttori di ESBL dalla Germania (n=1) e dall’Italia (n=1) è stato inoltre dimostrata la presenza di mcr-1, un gene del plasmide codificato resistente alla colistina. Sei campioni (7.5%), provenienti dalla Germania, sono risultati positivi allo MRSA. La genotipizzazione ha catalogato 3 dei ceppi del clone associato agli animali da reddito CC398 MRSA V T034 e altri 3 del CC9-MRSA-IV-t13177. Quest’ultimo è descritto in questo lavoro per la prima volta nei campioni di carne di pollame.