Science

English

Single-locus disorders in domesticated animals were among the first Mendelian traits to be documented, and to be included in early linkage maps. The use of linkage maps and comparative genomics has been essential to the identification of the causative genes for disorders. A DNA marker for selection of resistance to F18+ E. coli in the pig is available since several years. The use of this marker decreases mortality due to post-weaning diarrhoea and/or oedema disease. For more than 100 disorders the molecular lesion has been identified and hence for which a DNA test is available. However, for most diseases such as Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome (PRRS) and Porcine Circovirus Associated Diseases (PCVAD), resistance is a complex and polygenic trait. Novel technologies such as gene microarrays and advanced bioinformatics are being used to analyse health data. Lagging behind, however, is availability of large DNA data sets from pedigreed populations with accurately measured health phenotypes that are needed to identify associations between markers and health traits. As the pig genome is sequenced to a great extent and ten thousands of markers can be analysed at a reasonable price, genomic selection for health traits is possible.

Keywords: pig,inherited disease,selection for resistance,E. coli F4/F18 receptors

Deutsch

Ein-Locus-Erbkrankheiten bei Nutztieren gehören zu den ersten nach Mendel vererbten Merkmalen, die bereits in früheren Genkarten dokumentiert sind. Der Gebrauch von Gen- und Kopplungskarten und der vergleichenden Genomik zwischen Spezies ist zentral für die Identifikation von ursächlichen Genen für Krankheiten. Ein DNS-Marker für Selektion auf Resistenz gegen F18+ E. coli beim Schwein ist seit Jahren verfügbar. Die Anwendung dieses Markers in der Zucht führt zu verminderten Verlusten als Folgen von Absetzdurchfall und/oder Ödemkrankheit. Bei hunderten von Erbkrankheiten bei Nutztieren ist die molekulare Ursache bekannt. Für die meisten Krankheiten wie beispielsweise das Porcine Reproductive and Respiratory Syndrom (PRRS) und das Postweaning Multisystemic Wasting Syndrom (PMWS) ist die Resistenz komplex und ein polygenes Merkmal. Neue Technologien wie Microarray-Chips und moderne Bioinformatik werden für die Analyse von Gesundheitsdaten verwendet. Leider verfügen wir über keine grossen DNS-Datensätze von Familien mit präzis bestimmten Gesundheitsmerkmalen, um Beziehungen zwischen Markern und Gesundheitseigenschaften zu bestimmen. Da das Genom des Schweines grösstenteils sequenziert ist und zehntausende von Markern kostengünstig bestimmt werden können, ist die genomische Selektion für Gesundheitsmerkmale möglich.

Schlüsselwörter: Schwein,Erbkrankheit,Zucht auf Resistenz,E. coli F4/F18 Rezeptoren

Français

Les maladies monogéniques des animaux domestiques furent parmi les premières pathologiques génétiques mendéliennes documentées et répertoriées dans les premiers arbres génétiques. L'utilisation des arbres génétiques et de la comparaison génomique eut un rôle essentielle pour démontrer l'origine génétique de ces pathologies. Un marqueur ADN permettant la sélection de porcs résistant au E. coli F18+ est disponible depuis plusieurs années. L'utilisation de ce marqueur décroit la mortalité causée par la diarrhée post sevrage et/ou l'œdème. Pour plus de 100 pathologies, une anomalie génétique a été identifiée et un test ADN est disponible. Par contre, pour de nombreuses pathologies comme le syndrome respiratoire et de reproduction porcine (SRRP) et les maladies associées au circovirus porcin (MACVP), la résistance est un caractère complexe et polygénique. De nouvelles technologies comme les puces à ADN et la bio-informatique de pointe sont actuellement utilisées pour analyser ces données concernant la santé des animaux. Toutefois, il existe un grand retard concernant l'accessibilité de grandes quantités de données provenant d'animaux parfaitement typés sur des critères phénotypiques associés à la santé et qui sont indispensable pour identifier les liens entre les marqueurs ADN et santé. Comme le génome porcin est entièrement séquencé et que plus de10'000 marqueurs ADN peuvent être analysés pour un prix raisonnable, la sélection génétique sur la base de caractères modulant la santé des animaux est possible.

Italiano

Negli animali domestici i disordini del singolo locus sono stati tra i primi tratti mendeliani ad essere documentati ed essere inclusi nelle prime mappe di linkage. L'uso di mappe di linkage e di genomica comparativa sono stati essenziali per l'identificazione dei geni responsabili di malattie. Un marcatore di DNA per la selezione alla resistenza a F18+ E. coli nei suini è disponibile da diversi anni. L'uso di questo marcatore riduce la mortalità dovuta della diarrea post-svezzamento e/o l'edema. Per più di 100 disturbi è stata identificata la lesione molecolare, per la quale è disponibile un test del DNA. Tuttavia, per la maggior parte delle malattie come la sindrome riproduttiva e respiratoria dei suini (PRRS) e le malattie associata al circovirus suino (PCVAD), la resistenza è dovuta a un complesso tratto poligenico. Le nuove tecnologie, come gene microarray e la bioinformatica avanzata vengono utilizzati per analizzare i dati sanitari. Non tiene il passo, comunque, la disponibilità di grandi DNA dataset da popolazioni selezionate con fenotipi misurati con precisione, che sono necessari per identificare le associazioni tra i marcatori e i caratteri. Poiché il genoma del maiale sta venendo attivamente sequenziato e decine di migliaia di marcatori possono essere analizzati ad un prezzo ragionevole, la selezione genomica per caratteri è possibile.