Wissenschaft | Science

English

Between March 2011 and February 2012 83 E. coli strains were isolated from mastitis milk samples from 83 different animals (67 farms) and tested for their sensitivity to various antibiotics by means of disk diffusion method and genotyped by determination of the phylogenetic groups as well as by pulsed field gel electrophoresis (PFGE). The antibiotics were chosen on the basis of their licenses for intramammary application in Switzerland. As many as 16.9 % of the isolates were resistant to one or more antimicrobial agents. Amoxicillin-clavulanic acid, gentamicin and third generation cephalosporins proved effective against the majority of these strains. Nevertheless, one blaCTX-M-14 harbouring extended-spectrum-beta-lactamase producing strain was found. Genetic analysis grouped most of the strains (87 %) into phylogenetic groups A and B1. PFGE genotyping demonstrated that E. coli from cows with mastitis even from the same farm were genotypically very diverse.

Keywords: E. coli,mastitis,resistance,genotyping,phylogenetic group,PFGE

Deutsch

Zwischen März 2011 und Februar 2012 wurden 83 E. coli Stämme von 83 verschiedenen Kühen aus 67 Betrieben gesammelt und auf ihre Empfindlichkeit gegenüber verschiedenen Antibiotika getestet. Die Antibiotika wurden aufgrund der Zulassung für eine intramammäre Applikation in der Schweiz ausgesucht und die Empfindlichkeitstestung mittels Agardiffusions-Methode durchgeführt. Zudem wurden alle Stämme hinsichtlich ihrer Zugehörigkeit zu den phylogenetischen Gruppen wie auch mittels Pulsfeldgelelektrophorese (PFGE) genotypisiert. 16.9 % aller Stämme zeigten Resistenzen gegenüber einem oder mehreren Antibiotika. Amoxicillin-Clavulansäure, Gentamicin und Cephalosporine der dritten Generation erwiesen sind als wirksam gegen die Mehrheit der E. coli Stämme. Jedoch wurde ein extended-Spectrum-beta-Lactamase Bildner, welcher das blaCTX-M-14-Gen trägt, gefunden. Die genetische Analyse gruppierte das Gros der Stämme (87 %) in die phylogentischen Guppen A und B1. Die weitere Genotypisierung mittels PFGE zeigte eine grosse Diversität unter den E. coli Stämmen, auch wenn diese vom selben Betrieb stammten.

Schlüsselwörter: E. coli,Mastitis,Resistenz,Genotypisierung,phylogenetische Gruppen,PFGE

Français

Entre mars 2011 et février 2012, 83 souches d'E. coli issues de 83 vaches différentes provenant de 67 exploitations ont été collectées et testées quant à leur sensibilité vis-à-vis de divers antibiotiques. Ces antibiotiques ont été choisis sur la base de leurs autorisations pour l'application intra mammaire en Suisse et le test a été effectué par diffusion sur gel d'agar. En outre toutes les souches ont été typisées quant à leur appartenance aux groupes phylogénétiques. 16.9 % des souches présentaient une résistance à un ou plusieurs antibiotiques. L'amoxicilline-acide clavulanique, la gentamicine et les céphalosporines de troisièmes générations se montraient efficaces contre la majorité des souches d'E. coli. On a toutefois trouvé une souche fabriquant un extended-spectrum-beta-lactamase qui portait le gène blaCTX-M-14. L'analyse génétique groupait la majorité des souches (87 %) dans les groupes phylogénétiques A et B1. La génotypisation par PFGE montrait une grande diversité entre les souches, même si elles provenaient de la même exploitation.

Italiano

Tra marzo 2011 e febbraio 2012 sono stati raccolti 83 ceppi di E. coli da 83 bovini differenti provenienti da 67 aziende e testati rispetto alla loro sensibilità ai diversi antibiotici. Gli antibiotici sono stai scelti in virtù dell'approvazione in Svizzera per l'applicazione intramammaria e il test sulla sensibilità è stato effettuato mediante il metodo di diffusione in agar. Inoltre tutti i ceppi sono stati fenotipizzati in rapporto alla loro appartenenza a gruppi filogenetici, nonché via electroforesi su gel a campo forzato (PFGE). Il 16.9% di tutti i ceppi hanno esibito resistenze a uno o più antibiotici. Amoxicillina e acido clavulanico, gentamicina e cefalosporine della terza generazione hanno manifestato un'efficacia contro la maggior parte dei ceppi di E. coli. Tuttavia, è stato trovato della beta-lattamasi a spettro esteso portatrice del gene blaCTX-M-14. L'analisi genetica ha raggruppato la maggioranza dei ceppi (87%) nei gruppi filogenetici A e B1. Un'ulteriore genotipizzazione mediante PFGR ha mostrato una grande diversità tra i ceppi di E. coli anche se questi provenivano dalla medesima azienda.